RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491824.1

HCLS1-210, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 3

Gene HCLS1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-210ENST00000491824 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 SPON1Q9HCB6 807 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 LRP5O75197 1615 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 AK7Q96M32 723 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 ATG3Q9NT62 314 aa21.91■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 ATP6V1AP38606 617 aa21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 AKT1S1Q96B36 256 aa21.9■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.89■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 C5P01031 1676 aa21.89■■□□□ 1.1
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF827Q17R98 1081 aa21.89■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 MSH5O43196 834 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 MRC1P22897 1456 aa21.88■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.87■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 LGR6Q9HBX8 967 aa21.87■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.86■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 MTFR1LQ9H019 292 aa21.86■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 ZBTB7AO95365 584 aa21.85■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.85■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 CASZ1Q86V15 1759 aa21.84■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HCLS1-210ENST00000491824 C4BP0C0L5 1744 aa21.83■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.83■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.82■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 CCER2I3L3R5 266 aa21.82■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.81■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 GNPATO15228 680 aa21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 POLD1P28340 1107 aa21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 ITPK1Q13572 414 aa21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 SSFA2P28290 1259 aa21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 NFE2L2Q16236 605 aa21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 IL17REQ8NFR9 667 aa21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 PHF14O94880 888 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 BTBD11A6QL63 1104 aa21.77■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 SLC39A6Q13433 755 aa21.77■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 MCM10Q7L590 875 aa21.77■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.77■■□□□ 1.08
HCLS1-210ENST00000491824 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.77■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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HCLS1-210ENST00000491824 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.75■■□□□ 1.07
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HCLS1-210ENST00000491824 ADRA2BP18089 450 aa21.74■■□□□ 1.07
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HCLS1-210ENST00000491824 MIER1Q8N108 512 aa21.73■■□□□ 1.07
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HCLS1-210ENST00000491824 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 RIPK4P57078 832 aa21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 DCTN1Q14203 1278 aa21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 ARXQ96QS3 562 aa21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-210ENST00000491824 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.7■■□□□ 1.06
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HCLS1-210ENST00000491824 PTGER2P43116 358 aa21.7■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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HCLS1-210ENST00000491824 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.7■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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HCLS1-210ENST00000491824 MSL1Q68DK7 614 aa21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 MRS2Q9HD23 443 aa21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 TJP1Q07157 1748 aa21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 NEUROD2Q15784 382 aa21.66■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.65■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 KLHL34Q8N239 644 aa21.65■■□□□ 1.06
HCLS1-210ENST00000491824 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-210ENST00000491824 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
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