RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	KDM4A	O75164	1064 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	GJB2	P29033	226 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	CD109	Q6YHK3	1445 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	AMPH	P49418	695 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2H	P62256	183 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	LRMP	Q12912	555 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	IDI1	Q13907	227 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	SYT1	P21579	422 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	DMTN	Q08495	405 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	MSH6	P52701	1360 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP10A	O60312	1499 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ERCC3-208	ENST00000491292	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	GNAI3	P08754	354 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CHML	P26374	656 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	AK2	P54819	239 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT85	P78386	507 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX11	Q96FC9	970 aa		11.71	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXO3	O43524	673 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCC4	O15439	1325 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	F13A1	P00488	732 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	TPM3	P06753	285 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	NRDC	O43847	1150 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	NSD2	O96028	1365 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB22	O15209	634 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ANXA1	P04083	346 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF165	P49910	485 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	SIL1	Q9H173	461 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	SMC2	O95347	1197 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	TYRO3	Q06418	890 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	PLCH2	O75038	1416 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	FLII	Q13045	1269 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	SDF4	Q9BRK5	362 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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