RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491037.1

GAPDHP22-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 22, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP22, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP22-201ENST00000491037 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.36□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC15A2Q16348 729 aa11.36□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 STK32BQ9NY57 414 aa11.36□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.35□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.35□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 CABP4P57796 275 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 AKT1S1Q96B36 256 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 TJP1Q07157 1748 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.34□□□□□ -0.59
GAPDHP22-201ENST00000491037 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.33□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 SIK1P57059 783 aa11.33□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZNF827Q17R98 1081 aa11.33□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.33□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 ATG3Q9NT62 314 aa11.33□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.33□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 NEFMP07197 916 aa11.32□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.32□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.31□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 LGR6Q9HBX8 967 aa11.31□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.3□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.3□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.3□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 KCNQ4P56696 695 aa11.29□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 TEFQ10587 303 aa11.29□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.29□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 IL17REQ8NFR9 667 aa11.29□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.29□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 ANP32CO43423 234 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 ATP6V1AP38606 617 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 ITPK1Q13572 414 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 NFE2L2Q16236 605 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 MTFR1LQ9H019 292 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 SPON1Q9HCB6 807 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 C4AP0C0L4 1744 aa11.28□□□□□ -0.6
GAPDHP22-201ENST00000491037 SSFA2P28290 1259 aa11.27□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.27□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 AK7Q96M32 723 aa11.27□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.26□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.25□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZNF790Q6PG37 636 aa11.25□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.25□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 RUNDC1Q96C34 613 aa11.25□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.25□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.25□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 GNPATO15228 680 aa11.24□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZBTB7AO95365 584 aa11.24□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 PTGER2P43116 358 aa11.24□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 SLC39A6Q13433 755 aa11.24□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 MCM10Q7L590 875 aa11.24□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.24□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 BTBD11A6QL63 1104 aa11.23□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.23□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 SCN7AQ01118 1682 aa11.22□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 DCTN1Q14203 1278 aa11.22□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.22□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 RPS6KA4O75676 772 aa11.21□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 RIPK4P57078 832 aa11.21□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.21□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.21□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.21□□□□□ -0.61
GAPDHP22-201ENST00000491037 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 STARD3NLO95772 234 aa11.2□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 POLD1P28340 1107 aa11.2□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.2□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 MRS2Q9HD23 443 aa11.2□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 COL15A1P39059 1388 aa11.19□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 BCORQ6W2J9 1755 aa11.19□□□□□ -0.62
GAPDHP22-201ENST00000491037 PHF14O94880 888 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms