RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF827Q17R98 1081 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TJP1Q07157 1748 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.37□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.37□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.37□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZBTB7AO95365 584 aa7.37□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.37□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.36□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.36□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.36□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.35□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CYP27B1O15528 508 aa7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SYT17Q9BSW7 474 aa7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PALLDQ8WX93 1383 aa7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARXQ96QS3 562 aa7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POLKQ9UBT6 870 aa7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KDRP35968 1356 aa7.33□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MRC1P22897 1456 aa7.32□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 YY1P25490 414 aa7.32□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.32□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SBF1O95248 1867 aa7.32□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EYA1Q99502 592 aa7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPG7Q9UQ90 795 aa7.31□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POLD1P28340 1107 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KCNQ4P56696 695 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KLHL34Q8N239 644 aa7.3□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCN7AQ01118 1682 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BCORQ6W2J9 1755 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POTEMA6NI47 508 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PHKG2P15735 406 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PIGBQ92521 554 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PANK3Q9H999 370 aa7.29□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CACNA1SQ13698 1873 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POTEIP0CG38 1075 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SSFA2P28290 1259 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.28□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.27□□□□□ -1.24
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.27□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.27□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SIK1P57059 783 aa7.27□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPOCK2Q92563 424 aa7.27□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.27□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.27□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.27□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DCAF5Q96JK2 942 aa7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AK7Q96M32 723 aa7.26□□□□□ -1.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms