RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.2■■□□□ 1.78
ACTB-210ENST00000477812 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.19■■□□□ 1.78
ACTB-210ENST00000477812 WWC1Q8IX03 1113 aa26.19■■□□□ 1.78
ACTB-210ENST00000477812 ZNF521Q96K83 1311 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-210ENST00000477812 TEFQ10587 303 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-210ENST00000477812 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
ACTB-210ENST00000477812 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
ACTB-210ENST00000477812 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 ATG3Q9NT62 314 aa26.13■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.13■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 CCDC125Q86Z20 511 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.11■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 ZNF853P0CG23 659 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 WDR63Q8IWG1 891 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 LY75O60449 1722 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 IL16Q14005 1332 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 PALLDQ8WX93 1383 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 BTBD11A6QL63 1104 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 CHL1O00533 1208 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 APBA3O96018 575 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A6Q13433 755 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 PLSCR1O15162 318 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-210ENST00000477812 KCNQ3O43525 872 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 ZNF790Q6PG37 636 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 CFAP44Q96MT7 982 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 IFT57Q9NWB7 429 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.05■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 GNAI1P63096 354 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 PROM2Q8N271 834 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 BAG6P46379 1132 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 MBIPQ9NS73 344 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 RREB1Q92766 1687 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-210ENST00000477812 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 SIK1P57059 783 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 TTC5Q8N0Z6 440 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 TJP1Q07157 1748 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 TXNRD1Q16881 649 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA2Q08379 1002 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 ITPK1Q13572 414 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-210ENST00000477812 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 KCNQ4P56696 695 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 SLFN5Q08AF3 891 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 C5P01031 1676 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 E9PSI1 815 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 KRT24Q2M2I5 525 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 SOCS7O14512 581 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 ATP6V1AP38606 617 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-210ENST00000477812 C4BP0C0L5 1744 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 HOXB7P09629 217 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 TSPYL6Q8N831 410 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 USP16Q9Y5T5 823 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ACTB-210ENST00000477812 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms