RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MCM10Q7L590 875 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PROM2Q8N271 834 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NBPF14Q5TI25 921 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ITGB4P16144 1822 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DCTN1Q14203 1278 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BTAF1O14981 1849 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BTBD11A6QL63 1104 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC27Q2M243 656 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PALLDQ8WX93 1383 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SIK1P57059 783 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF790Q6PG37 636 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MRC1P22897 1456 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP6V1AP38606 617 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EP400Q96L91 3159 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC39A6Q13433 755 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STK32BQ9NY57 414 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WDR63Q8IWG1 891 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WWC1Q8IX03 1113 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CFAP44Q96MT7 982 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHL1O00533 1208 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GNAI1P63096 354 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LY75O60449 1722 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC15A2Q16348 729 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STARD3NLO95772 234 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IFT57Q9NWB7 429 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IL16Q14005 1332 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCNQ4P56696 695 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCNQ3O43525 872 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ITPK1Q13572 414 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AKT1S1Q96B36 256 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF853P0CG23 659 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RREB1Q92766 1687 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AK7Q96M32 723 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPS6KA4O75676 772 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MBIPQ9NS73 344 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP16Q9Y5T5 823 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PAPPAQ13219 1627 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADRA2BP18089 450 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF827Q17R98 1081 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HOXB7P09629 217 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SSFA2P28290 1259 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GOLGA2Q08379 1002 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms