RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 NME9Q86XW9 330 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 SIRT2Q8IXJ6 389 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 IDI1Q13907 227 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 POLKQ9UBT6 870 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 UVSSAQ2YD98 709 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP5L-202ENST00000475978 MNS1Q8NEH6 495 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 GPATCH3Q96I76 525 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 AMPHP49418 695 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 GPATCH11Q8N954 259 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 MYRIPQ8NFW9 859 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CNTROBQ8N137 903 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC52A1Q9NWF4 448 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CAMK4Q16566 473 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 FBXW7Q969H0 707 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 FERMT3Q86UX7 667 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCDC83Q8IWF9 413 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 TSPYL1Q9H0U9 437 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 ABCC4O15439 1325 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 H3BQV1 296 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 IFFO2Q5TF58 517 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 STX6O43752 255 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 UBE2HP62256 183 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CERS3Q8IU89 383 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PIBF1Q8WXW3 757 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 SETQ01105 290 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDLIM2Q96JY6 352 aa17.04■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 TNMDQ9H2S6 317 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CLEC17AQ6ZS10 378 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 BRD1O95696 1058 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRT85P78386 507 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 CLTCL1P53675 1640 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 PTPRCP08575 1304 aa17.02■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP5L-202ENST00000475978 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.02■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TNNT1P13805 278 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 MAP3K11Q16584 847 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 IQGAP1P46940 1657 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 MSH6P52701 1360 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ANAPC15P60006 121 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CKAP2LQ8IYA6 745 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 KRT222Q8N1A0 295 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 DEF6Q9H4E7 631 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 MYOM2P54296 1465 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDRG1Q9NUG6 133 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 KDM4AO75164 1064 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 FOSBP53539 338 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPG7Q9UQ90 795 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ATP7AQ04656 1500 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDCP20941 246 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 AK9Q5TCS8 1911 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 DTNBO60941 627 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CHMLP26374 656 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5L-202ENST00000475978 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 226.3 ms