RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475527.1

PTPRG-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRG, Length 2,694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-205ENST00000475527 RAPGEF3O95398 923 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRG-205ENST00000475527 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRG-205ENST00000475527 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
PTPRG-205ENST00000475527 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PTPRG-205ENST00000475527 F6X3S4 739 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 CHL1O00533 1208 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 COG3Q96JB2 828 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 ATP7BP35670 1465 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 ADCY5O95622 1261 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.37■■□□□ 1.49
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PTPRG-205ENST00000475527 CHMLP26374 656 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 ANAPC15P60006 121 aa24.36■■□□□ 1.49
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PTPRG-205ENST00000475527 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 FAM177BA6PVY3 158 aa24.35■■□□□ 1.49
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PTPRG-205ENST00000475527 G2E3Q7L622 706 aa24.35■■□□□ 1.49
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PTPRG-205ENST00000475527 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRG-205ENST00000475527 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRG-205ENST00000475527 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRG-205ENST00000475527 TCHHQ07283 1943 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRG-205ENST00000475527 GNAI2P04899 355 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRG-205ENST00000475527 KIAA0232Q92628 1395 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRG-205ENST00000475527 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.31■■□□□ 1.48
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PTPRG-205ENST00000475527 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.31■■□□□ 1.48
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PTPRG-205ENST00000475527 CBX1P83916 185 aa24.29■■□□□ 1.48
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PTPRG-205ENST00000475527 KIF3AQ9Y496 699 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRG-205ENST00000475527 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRG-205ENST00000475527 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.483e-6■■■□□ 16.2
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PTPRG-205ENST00000475527 IL25Q9H293 177 aa24.27■■□□□ 1.48
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PTPRG-205ENST00000475527 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.26■■□□□ 1.47
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PTPRG-205ENST00000475527 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 FIBPO43427 364 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 SSH2Q76I76 1423 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 CPS1P31327 1500 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 UBE2HP62256 183 aa24.24■■□□□ 1.47
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PTPRG-205ENST00000475527 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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PTPRG-205ENST00000475527 ATP2B3Q16720 1220 aa24.22■■□□□ 1.47
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PTPRG-205ENST00000475527 STX6O43752 255 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 ATP8B2P98198 1209 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 PLEKHG5O94827 1062 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 SYT1P21579 422 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 IL17RAQ96F46 866 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 SPC24Q8NBT2 197 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRG-205ENST00000475527 FOXO3O43524 673 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 GNAI3P08754 354 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.2■■□□□ 1.46
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PTPRG-205ENST00000475527 AP5Z1O43299 807 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 DTNBO60941 627 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 STK31Q9BXU1 1019 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 CRB1P82279 1406 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 AK2P54819 239 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 NECTIN2Q92692 538 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRG-205ENST00000475527 F13A1P00488 732 aa24.18■■□□□ 1.46
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