RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472004.5

GYS1-204, Transcript of glycogen synthase 1, human

TSL 3

Gene GYS1, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYS1-204	ENST00000472004	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF853	P0CG23	659 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		18.51	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		18.51	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	SLC39A6	Q13433	755 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	MRC1	P22897	1456 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	FAM182B	Q5T319	152 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF790	Q6PG37	636 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	POTEA	Q6S8J7	498 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GYS1-204	ENST00000472004	NEFL	P07196	543 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	PIGB	Q92521	554 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	STK31	Q9BXU1	1019 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	KCNQ3	O43525	872 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF428	Q96B54	188 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	KRT24	Q2M2I5	525 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	TSPYL6	Q8N831	410 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	BCL9	O00512	1426 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	NECTIN2	Q92692	538 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	RGS12	O14924	1447 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	ITGB4	P16144	1822 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	VAMP4	O75379	141 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GYS1-204	ENST00000472004	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	KCNQ2	O43526	872 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	HOXB7	P09629	217 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	ATG3	Q9NT62	314 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	BCAR3	O75815	825 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	KIF16B	Q96L93	1317 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	NHS	Q6T4R5	1651 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	PALLD	Q8WX93	1383 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	TRIM37	O94972	964 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	PAPPA	Q13219	1627 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	STARD3NL	O95772	234 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	SLC4A2	P04920	1241 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GYS1-204	ENST00000472004	ATP6V1A	P38606	617 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	MS4A1	P11836	297 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	PLIN1	O60240	522 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	SIK1	P57059	783 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	MYL6B	P14649	208 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GYS1-204	ENST00000472004	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52

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