RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471532.5

BAP1-206, Transcript of BRCA1 associated protein 1, human

TSL 5

Gene BAP1, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BAP1-206	ENST00000471532	IL16	Q14005	1332 aa		27.94	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	ZNF853	P0CG23	659 aa		27.94	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	CABP4	P57796	275 aa		27.94	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		27.94	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		27.94	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	KCNQ2	O43526	872 aa		27.93	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	GOLGA2	Q08379	1002 aa		27.93	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.93	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	PIGB	Q92521	554 aa		27.91	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	IFT57	Q9NWB7	429 aa		27.91	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	CFAP44	Q96MT7	982 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	CHL1	O00533	1208 aa		27.89	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	MBIP	Q9NS73	344 aa		27.89	■■■□□ 2.06
BAP1-206	ENST00000471532	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.89	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	C5	P01031	1676 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	KCNQ3	O43525	872 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	GNAI1	P63096	354 aa		27.87	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	SLC39A6	Q13433	755 aa		27.87	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.86	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532		E9PSI1	815 aa		27.86	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		27.86	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		27.84	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	LY75	O60449	1722 aa		27.84	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.83	■■■□□ 2.05
BAP1-206	ENST00000471532	TJP1	Q07157	1748 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	TRIM37	O94972	964 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	ZNF790	Q6PG37	636 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	EP400	Q96L91	3159 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		27.77	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
BAP1-206	ENST00000471532	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.75	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.75	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		27.74	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		27.74	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.74	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		27.73	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		27.72	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.72	■■■□□ 2.03
BAP1-206	ENST00000471532	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	RREB1	Q92766	1687 aa		27.65	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.65	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	SIK1	P57059	783 aa		27.65	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	VAMP4	O75379	141 aa		27.64	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	APBA3	O96018	575 aa		27.64	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	KCNQ4	P56696	695 aa		27.64	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	ITPK1	Q13572	414 aa		27.64	■■■□□ 2.02
BAP1-206	ENST00000471532	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		27.63	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.61	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		27.6	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	C4B	P0C0L5	1744 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	HOXB7	P09629	217 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.59	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	PROM2	Q8N271	834 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		27.58	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
BAP1-206	ENST00000471532	PLSCR1	O15162	318 aa		27.57	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.56	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		27.56	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	TXNRD1	Q16881	649 aa		27.55	■■■□□ 2
BAP1-206	ENST00000471532	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		27.55	■■■□□ 2

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