RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469849.1

INO80B-206, Transcript of INO80 complex subunit B, human

TSL 5

Gene INO80B, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
INO80B-206	ENST00000469849	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		40.9	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		40.9	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	40.89	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	SMIM5	Q71RC9	77 aa		40.89	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		40.89	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	C5	P01031	1676 aa		40.88	■■■■■ 4.14
INO80B-206	ENST00000469849	PRKAR2B	P31323	418 aa		40.88	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		40.88	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		40.87	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	MSH5	O43196	834 aa		40.85	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		40.85	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		40.85	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		40.84	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	AK7	Q96M32	723 aa		40.83	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.13
INO80B-206	ENST00000469849	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		40.81	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		40.81	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	C4B	P0C0L5	1744 aa		40.81	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		40.8	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	RALBP1	Q15311	655 aa		40.79	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	FCHSD2	O94868	740 aa		40.78	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		40.78	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		40.77	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	PHF14	O94880	888 aa		40.76	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	SLC39A6	Q13433	755 aa		40.76	■■■■■ 4.12
INO80B-206	ENST00000469849	MAP3K5	Q99683	1374 aa		40.74	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	ARX	Q96QS3	562 aa		40.74	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	MSL1	Q68DK7	614 aa		40.73	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		40.73	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	GNPAT	O15228	680 aa		40.72	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	40.71	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	MRC1	P22897	1456 aa		40.7	■■■■■ 4.11
INO80B-206	ENST00000469849	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		40.69	■■■■■ 4.1
INO80B-206	ENST00000469849	POLD1	P28340	1107 aa		40.67	■■■■■ 4.1
INO80B-206	ENST00000469849	SSFA2	P28290	1259 aa		40.66	■■■■■ 4.1
INO80B-206	ENST00000469849	SYT17	Q9BSW7	474 aa		40.66	■■■■■ 4.1
INO80B-206	ENST00000469849	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		40.65	■■■■■ 4.1
INO80B-206	ENST00000469849	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
INO80B-206	ENST00000469849	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
INO80B-206	ENST00000469849	TEF	Q10587	303 aa		40.63	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		40.62	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		40.62	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		40.61	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		40.6	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		40.59	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	MCM10	Q7L590	875 aa		40.59	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		40.59	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	RPS6KA4	O75676	772 aa		40.58	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	DCTN1	Q14203	1278 aa		40.58	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		40.58	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	KLHL34	Q8N239	644 aa		40.58	■■■■■ 4.09
INO80B-206	ENST00000469849	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	40.56	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		40.56	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	40.54	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	40.54	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	TJP1	Q07157	1748 aa		40.53	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	KCNQ3	O43525	872 aa		40.53	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	ZNF790	Q6PG37	636 aa		40.53	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		40.52	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
INO80B-206	ENST00000469849	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	BTBD11	A6QL63	1104 aa		40.49	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	NEFM	P07197	916 aa		40.49	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		40.47	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		40.47	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	ADRA2B	P18089	450 aa		40.46	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	RFC4	P35249	363 aa		40.45	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	NFE2L2	Q16236	605 aa		40.45	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		40.45	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
INO80B-206	ENST00000469849	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		40.42	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		40.41	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		40.41	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		40.41	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	GYS1	P13807	737 aa		40.4	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		40.4	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		40.39	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		40.39	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
INO80B-206	ENST00000469849	MMP10	P09238	476 aa		40.37	■■■■■ 4.05
INO80B-206	ENST00000469849	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		40.37	■■■■■ 4.05
INO80B-206	ENST00000469849	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		40.37	■■■■■ 4.05
INO80B-206	ENST00000469849	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	40.37	■■■■■ 4.05
INO80B-206	ENST00000469849	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
INO80B-206	ENST00000469849	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05

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