RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 GNAI1P63096 354 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 MBIPQ9NS73 344 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 CFAP44Q96MT7 982 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 ITGB4P16144 1822 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 CHL1O00533 1208 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 MRC1P22897 1456 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 FAM182BQ5T319 152 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 CABP4P57796 275 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 BCL9O00512 1426 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-206ENST00000465525 BTBD11A6QL63 1104 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 KCNQ3O43525 872 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 KRT24Q2M2I5 525 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 SLC39A6Q13433 755 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 TSPYL6Q8N831 410 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 PAPPAQ13219 1627 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-206ENST00000465525 PIGBQ92521 554 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 SBF2Q86WG5 1849 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 KCNQ2O43526 872 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF790Q6PG37 636 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 C5P01031 1676 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 EP400Q96L91 3159 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 NHSQ6T4R5 1651 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM37O94972 964 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 VAMP4O75379 141 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
PTPRU-206ENST00000465525 BTAF1O14981 1849 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 ATG3Q9NT62 314 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 NECTIN2Q92692 538 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 BCAR3O75815 825 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRU-206ENST00000465525 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRU-206ENST00000465525 ILDR2Q71H61 639 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC125Q86Z20 511 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 PLIN1O60240 522 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 APBA3O96018 575 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 PALLDQ8WX93 1383 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 TJP1Q07157 1748 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 PLSCR1O15162 318 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 USP16Q9Y5T5 823 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 HOXB7P09629 217 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF428Q96B54 188 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRU-206ENST00000465525 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 ANXA1P04083 346 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 SIK1P57059 783 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 KCNQ4P56696 695 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.06■■□□□ 1.12
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