RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460778.1

RPL23AP56-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 56, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP56, Length 453 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP56-201ENST00000460778 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 RIPK4P57078 832 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 MCM10Q7L590 875 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 PROM2Q8N271 834 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 PIGBQ92521 554 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 DCAF5Q96JK2 942 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 BCL9O00512 1426 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 NHSQ6T4R5 1651 aa6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.48□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 KCNQ3O43525 872 aa6.48□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.48□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.48□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.48□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 MAP3K5Q99683 1374 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 KCNQ4P56696 695 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 CABP4P57796 275 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLC39A6Q13433 755 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 WWC1Q8IX03 1113 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 ATG3Q9NT62 314 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 LY75O60449 1722 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.46□□□□□ -1.37
RPL23AP56-201ENST00000460778 APBA3O96018 575 aa6.46□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 NEFMP07197 916 aa6.46□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF853P0CG23 659 aa6.46□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.46□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.46□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.46□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 CHL1O00533 1208 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 PLSCR1O15162 318 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 TEFQ10587 303 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCDC27Q2M243 656 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 POTEHQ6S545 545 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCDC125Q86Z20 511 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF521Q96K83 1311 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 PAPPAQ13219 1627 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SOCS7O14512 581 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SPDYE6P0CI01 402 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 ITPK1Q13572 414 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF790Q6PG37 636 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 MRC1P22897 1456 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 BTBD11A6QL63 1104 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 TXNRD1Q16881 649 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 KRT24Q2M2I5 525 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 WDR63Q8IWG1 891 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 CFAP44Q96MT7 982 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 TJP1Q07157 1748 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SIK1P57059 783 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLFN5Q08AF3 891 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SMIM5Q71RC9 77 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 NGEFQ8N5V2 710 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 MBIPQ9NS73 344 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 USP16Q9Y5T5 823 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL23AP56-201ENST00000460778 C5P01031 1676 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms