RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 PLCH2O75038 1416 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 DEPDC5O75140 1603 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 TIMP2P16035 220 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXJ1Q92949 421 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP10Q9P2G4 905 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 UTRNP46939 3433 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM66O15016 1216 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 AGERQ15109 404 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 C8orf37Q96NL8 207 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 CDK15Q96Q40 435 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 SHPRHQ149N8 1683 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ERBB4Q15303 1308 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 TSC1Q92574 1164 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 AK7Q96M32 723 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 NR5A1Q13285 461 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM94Q12767 1356 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 SOBPA7XYQ1 873 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 NR3C2P08235 984 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 ITPKCQ96DU7 683 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 SLAIN2Q9P270 581 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 TNRQ92752 1358 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 MAN1A2O60476 641 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 UPP2O95045 317 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 GRM5P41594 1212 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 PRELPP51888 382 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 BMP2P12643 396 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 QPCTQ16769 361 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP3K1Q13233 1512 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF14Q15058 1648 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP7AQ04656 1500 aa8.34□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 LILRB3O75022 631 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 PDE4DQ08499 809 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 NBPF14Q5TI25 921 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 GGT6Q6P531 493 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 VSIG8P0DPA2 414 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 MSH6P52701 1360 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 FSHRP23945 695 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 MEIOBQ8N635 442 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 PPFIA3O75145 1194 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 USP21Q9UK80 565 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAMTS2O95450 1211 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms