RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 USP6P35125 1406 aa18.21■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.21■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RTL1A6NKG5 1358 aa18.21■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 ITSN1Q15811 1721 aa18.2■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.2■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 C3P01024 1663 aa18.2■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 DYNC1I1O14576 645 aa18.2■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 MSH6P52701 1360 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 FOXO3O43524 673 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.19■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 MCM2P49736 904 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 AMPHP49418 695 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TMX3Q96JJ7 454 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 AKAP12Q02952 1782 aa18.18■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 APBB1O00213 710 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 BRD1O95696 1058 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRCP08575 1304 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 NEK4P51957 841 aa18.16■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TBX22Q9Y458 520 aa18.16■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CHL1O00533 1208 aa18.16■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
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TOP3B-206ENST00000436282 NLRP6P59044 892 aa18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CUL4AQ13619 759 aa18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TSPY26PQ9H489 355 aa18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 HMMRO75330 724 aa18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 RNF214Q8ND24 703 aa18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA0232Q92628 1395 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 PDE1AP54750 535 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 C14orf37Q86TY3 774 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 KCNA6P17658 529 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 USP31Q70CQ4 1352 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 SLC4A2P04920 1241 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 MCCP23508 829 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 EYA1Q99502 592 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 PHF14O94880 888 aa18.11■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 ANAPC15P60006 121 aa18.11■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.11■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.1■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 FLT4P35916 1363 aa18.09■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.09■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 PEAK1Q9H792 1746 aa18.09■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 SSH2Q76I76 1423 aa18.09■□□□□ 0.49
TOP3B-206ENST00000436282 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.08■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SBNO1A3KN83 1393 aa18.08■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.08■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ABTB2Q8N961 1025 aa18.08■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.08■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 F6X3S4 739 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHG5O94827 1062 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 UVSSAQ2YD98 709 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 NECTIN2Q92692 538 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 IL17RAQ96F46 866 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 PALD1Q9ULE6 856 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 G2E3Q7L622 706 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF10O15013 1369 aa18.07■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.06■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.06■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 CRB1P82279 1406 aa18.05■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.05■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.05■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 DIP2AQ14689 1571 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 CHMLP26374 656 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SLIT1O75093 1534 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 MX1P20591 662 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 USP48Q86UV5 1035 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.04■□□□□ 0.48
TOP3B-206ENST00000436282 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.04■□□□□ 0.48
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