RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

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Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 GNAI2P04899 355 aa20.62■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.62■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.62■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.62■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 ACEP12821 1306 aa20.61■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.61■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 PDE1AP54750 535 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 DCTN1Q14203 1278 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 MEIS3Q99687 375 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 SLIT1O75093 1534 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.6■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 STK31Q9BXU1 1019 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 STAP2Q9UGK3 403 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 SOCS7O14512 581 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 SLC4A2P04920 1241 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 MCM5P33992 734 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 CUL4AQ13619 759 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 ARXQ96QS3 562 aa20.59■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.58■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.57■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 MCTP1Q6DN14 999 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 ILDR2Q71H61 639 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.56■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 MCM10Q7L590 875 aa20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 ATP8B2P98198 1209 aa20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 ERBB4Q15303 1308 aa20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.53■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 PIK3C2AO00443 1686 aa20.53■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 AK9Q5TCS8 1911 aa20.53■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 RAB11FIP3O75154 756 aa20.52■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 MX1P20591 662 aa20.52■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.52■□□□□ 0.88
HCLS1-202ENST00000428394 BRD1O95696 1058 aa20.51■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.51■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 STRCQ7RTU9 1775 aa20.51■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 OFD1O75665 1012 aa20.51■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 PHF14O94880 888 aa20.51■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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HCLS1-202ENST00000428394 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 KRT24Q2M2I5 525 aa20.5■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.5■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 HOXB7P09629 217 aa20.49■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 FLIIQ13045 1269 aa20.49■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 TMX3Q96JJ7 454 aa20.49■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K5Q99683 1374 aa20.49■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 CHMLP26374 656 aa20.48■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 NWD1Q149M9 1564 aa20.48■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 NEK4P51957 841 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 TBX22Q9Y458 520 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHG5O94827 1062 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 SSH3Q8TE77 659 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.45■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.45■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 G2E3Q7L622 706 aa20.45■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.45■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 GPT2Q8TD30 523 aa20.45■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 EID1Q9Y6B2 187 aa20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 LTKP29376 864 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 AMPHP49418 695 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 EYA1Q99502 592 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.43■□□□□ 0.86
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