RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXA4-202ENST00000428284 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
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HOXA4-202ENST00000428284 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 IL16Q14005 1332 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 BTAF1O14981 1849 aa26.86■■□□□ 1.89
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HOXA4-202ENST00000428284 IFT57Q9NWB7 429 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 EP400Q96L91 3159 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 GNAI1P63096 354 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP44Q96MT7 982 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 PAPPAQ13219 1627 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 BTBD11A6QL63 1104 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 KCNQ2O43526 872 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 PIGBQ92521 554 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXA4-202ENST00000428284 E9PSI1 815 aa26.82■■□□□ 1.88
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HOXA4-202ENST00000428284 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.8■■□□□ 1.88
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HOXA4-202ENST00000428284 CHL1O00533 1208 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-202ENST00000428284 SLFN5Q08AF3 891 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC125Q86Z20 511 aa26.8■■□□□ 1.88
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HOXA4-202ENST00000428284 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXA4-202ENST00000428284 SLC39A6Q13433 755 aa26.78■■□□□ 1.88
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HOXA4-202ENST00000428284 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA4-202ENST00000428284 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF790Q6PG37 636 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXA4-202ENST00000428284 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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HOXA4-202ENST00000428284 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXA4-202ENST00000428284 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-202ENST00000428284 ATG3Q9NT62 314 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXA4-202ENST00000428284 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXA4-202ENST00000428284 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.71■■□□□ 1.87
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HOXA4-202ENST00000428284 LY75O60449 1722 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXA4-202ENST00000428284 PALLDQ8WX93 1383 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXA4-202ENST00000428284 C5P01031 1676 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-202ENST00000428284 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXA4-202ENST00000428284 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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HOXA4-202ENST00000428284 APBA3O96018 575 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.63■■□□□ 1.85
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HOXA4-202ENST00000428284 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 BAG6P46379 1132 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 SIK1P57059 783 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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HOXA4-202ENST00000428284 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXA4-202ENST00000428284 ATP6V1AP38606 617 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.58■■□□□ 1.85
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HOXA4-202ENST00000428284 PLSCR1O15162 318 aa26.56■■□□□ 1.84
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HOXA4-202ENST00000428284 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXA4-202ENST00000428284 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXA4-202ENST00000428284 KCNQ4P56696 695 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXA4-202ENST00000428284 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXA4-202ENST00000428284 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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HOXA4-202ENST00000428284 NECTIN2Q92692 538 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA4-202ENST00000428284 USP16Q9Y5T5 823 aa26.53■■□□□ 1.84
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HOXA4-202ENST00000428284 TXNRD1Q16881 649 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-202ENST00000428284 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.51■■□□□ 1.83
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