RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427669.5

CCDC18-AS1-207, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 383 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 WNK3Q9BYP7 1800 aa13□□□□□ -0.33
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RXRBP28702 533 aa13□□□□□ -0.33
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa13□□□□□ -0.33
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CHMP4AQ9BY43 222 aa13□□□□□ -0.33
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.98□□□□□ -0.33
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.98□□□□□ -0.33
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 FAM196AQ6ZSG2 479 aa12.94□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SLC39A6Q13433 755 aa12.93□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.93□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.92□□□□□ -0.34
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ATG3Q9NT62 314 aa12.92□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RGS12O14924 1447 aa12.91□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.91□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.91□□□□□ -0.34
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.9□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa12.9□□□□□ -0.34
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ERBB4Q15303 1308 aa12.89□□□□□ -0.35
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 STK31Q9BXU1 1019 aa12.89□□□□□ -0.35
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 BCAR3O75815 825 aa12.88□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PAPPAQ13219 1627 aa12.88□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PALLDQ8WX93 1383 aa12.87□□□□□ -0.35
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 MS4A1P11836 297 aa12.87□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.86□□□□□ -0.35
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CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SIK1P57059 783 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PDE3AQ14432 1141 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 FAM182BQ5T319 152 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PTPRCP08575 1304 aa12.86□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 STARD3NLO95772 234 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SLC4A2P04920 1241 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 HYPKQ9NX55 129 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 USP16Q9Y5T5 823 aa12.85□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NHSQ6T4R5 1651 aa12.84□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.84□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NEFLP07196 543 aa12.84□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.84□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.84□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PDIA6Q15084 440 aa12.83□□□□□ -0.36
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.83□□□□□ -0.36
CCDC18-AS1-207ENST00000427669 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.83□□□□□ -0.36
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