RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MBIPQ9NS73 344 aa12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNNQ9UQP3 1299 aa12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLIT2O94813 1529 aa12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL2RBP14784 551 aa12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.66□□□□□ -0.38
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa12.61□□□□□ -0.39
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BARGINQ6ZT62 677 aa12.6□□□□□ -0.39
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.6□□□□□ -0.39
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.6□□□□□ -0.39
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNS2Q63HR2 1409 aa12.57□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.57□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.57□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LGR6Q9HBX8 967 aa12.57□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF16BQ96L93 1317 aa12.56□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDB1Q16531 1140 aa12.56□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.56□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.55□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CYP27B1O15528 508 aa12.55□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERVV-2B6SEH9 535 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MS4A1P11836 297 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
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