RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA0232Q92628 1395 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 IQCDQ96DY2 449 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 STK24Q9Y6E0 443 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 NOS1P29475 1434 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 ATP7BP35670 1465 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 EVI5LQ96CN4 794 aa8.4□□□□□ -1.06
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ALMS1-201ENST00000423048 CEP170Q5SW79 1584 aa8.4□□□□□ -1.06
ALMS1-201ENST00000423048 TET3O43151 1660 aa8.4□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.4□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.4□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 NPATQ14207 1427 aa8.39□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 RUFY1Q96T51 708 aa8.39□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 A6NNZ2 444 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 MAP9Q49MG5 647 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 HOOK3Q86VS8 718 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PTPRTO14522 1441 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 G3V3G9 751 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.39□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.38□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.38□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.38□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.38□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ARXQ96QS3 562 aa8.38□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGEF10O15013 1369 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 FLT4P35916 1363 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 RAB34Q9BZG1 259 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ERBB4Q15303 1308 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CABP2Q9NPB3 220 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 STARD3NLO95772 234 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 SPAG1Q07617 926 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 LNPKQ9C0E8 428 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.37□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.36□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 DESP17661 470 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 MX1P20591 662 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 NUCB1Q02818 461 aa8.36□□□□□ -1.07
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ALMS1-201ENST00000423048 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PTPRKQ15262 1439 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 STK38Q15208 465 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 MCTP1Q6DN14 999 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CNPY4Q8N129 248 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 SDF4Q9BRK5 362 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 FBXO3Q9UK99 471 aa8.36□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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