RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 MBIPQ9NS73 344 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCF2Q9UG63 623 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINC1P01008 464 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 SOGA3Q5TF21 947 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 IL16Q14005 1332 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM83GA6ND36 823 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX11Q96FC9 970 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.25■■□□□ 1.63
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PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 DACH1Q9UI36 760 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 CCP110O43303 1012 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 MAPKBP1O60336 1514 aa25.22■■□□□ 1.63
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PTPRJ-201ENST00000418331 CAGE1Q8TC20 777 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 TNRQ92752 1358 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A087WZG4 1122 aa25.21■■□□□ 1.63
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PTPRJ-201ENST00000418331 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.19■■□□□ 1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 AK7Q96M32 723 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP160Q12769 1436 aa25.18■■□□□ 1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 A2MP01023 1474 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 ASXL2Q76L83 1435 aa25.18■■□□□ 1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.18■■□□□ 1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.16■■□□□ 1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMTS2O95450 1211 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHDP01880 384 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 PIK3R4Q99570 1358 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 ZPR1O75312 459 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 CDR1P51861 262 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-201ENST00000418331 NAPBQ9H115 298 aa25.14■■□□□ 1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 MAP3K12Q12852 859 aa25.13■■□□□ 1.61
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PTPRJ-201ENST00000418331 EXOC5O00471 708 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP3K11Q16584 847 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 SYCE3A1L190 88 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 CBFA2T2O43439 604 aa25.12■■□□□ 1.61
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PTPRJ-201ENST00000418331 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 EVI5LQ96CN4 794 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC5A1P13866 664 aa25.1■■□□□ 1.61
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