RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

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Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXO3O43524 673 aa22.89■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.88■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 UQCRHP07919 91 aa22.88■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.88■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 ITSN1Q15811 1721 aa22.88■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.87■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.87■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.87■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 RILPL2Q969X0 211 aa22.86■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.86■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 CHMLP26374 656 aa22.86■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 MCM2P49736 904 aa22.86■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 MX1P20591 662 aa22.85■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 SOX12O15370 315 aa22.85■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 GNAI2P04899 355 aa22.85■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.85■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.84■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 MCM5P33992 734 aa22.84■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.84■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 TSPY26PQ9H489 355 aa22.84■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 PEAK1Q9H792 1746 aa22.84■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.84■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 IL25Q9H293 177 aa22.83■■□□□ 1.25
NEFHP1-201ENST00000412845 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 MCCP23508 829 aa22.82■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.82■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.81■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 NUTM2FA1L443 756 aa22.81■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 MPNDQ8N594 471 aa22.81■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.81■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 ANAPC15P60006 121 aa22.8■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.8■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 OSCARQ8IYS5 282 aa22.8■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 USP48Q86UV5 1035 aa22.79■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.79■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 NECTIN2Q92692 538 aa22.79■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.78■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.78■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP8B2P98198 1209 aa22.78■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 ACEP12821 1306 aa22.77■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.77■■□□□ 1.24
NEFHP1-201ENST00000412845 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 MLECQ14165 292 aa22.77■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.77■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 FLIIQ13045 1269 aa22.76■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.76■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 STAP2Q9UGK3 403 aa22.76■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 ARID3AQ99856 593 aa22.76■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.76■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 STK31Q9BXU1 1019 aa22.75■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 SSH2Q76I76 1423 aa22.75■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 DYNC1I1O14576 645 aa22.75■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 IL17RAQ96F46 866 aa22.75■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 GNAI3P08754 354 aa22.74■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.74■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP7D2Q96T17 732 aa22.74■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.73■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.73■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 USP25Q9UHP3 1055 aa22.73■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 HSPA4P34932 840 aa22.72■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.72■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 TECPR2O15040 1411 aa22.72■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.72■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.71■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF10O15013 1369 aa22.71■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 PHF14O94880 888 aa22.71■■□□□ 1.23
NEFHP1-201ENST00000412845 SIRT1Q96EB6 747 aa22.7■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 USP44Q9H0E7 712 aa22.69■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 USP6P35125 1406 aa22.69■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 PLEKHG5O94827 1062 aa22.69■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 USP31Q70CQ4 1352 aa22.69■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 DTNBO60941 627 aa22.68■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.68■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.67■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 EYA1Q99502 592 aa22.67■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.67■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.67■■□□□ 1.22
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