RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370495.5

SLC25A28-201, Transcript of solute carrier family 25 member 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A28, Length 1,451 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A28-201ENST00000370495 KAT6BQ8WYB5 2073 aa40.6■■■■■ 4.09
SLC25A28-201ENST00000370495 ITGB4P16144 1822 aa40.59■■■■■ 4.09
SLC25A28-201ENST00000370495 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
SLC25A28-201ENST00000370495 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
SLC25A28-201ENST00000370495 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SLC25A28-201ENST00000370495 BTAF1O14981 1849 aa40.51■■■■■ 4.08
SLC25A28-201ENST00000370495 ZNF521Q96K83 1311 aa40.5■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 BTBD11A6QL63 1104 aa40.5■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 ASAP1Q9ULH1 1129 aa40.49■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 WDR63Q8IWG1 891 aa40.48■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 MIS18AQ9NYP9 233 aa40.48■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 SLC39A6Q13433 755 aa40.47■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 ATG3Q9NT62 314 aa40.47■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 APBA3O96018 575 aa40.46■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
SLC25A28-201ENST00000370495 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 IFT57Q9NWB7 429 aa40.44■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 TSPYL4Q9UJ04 414 aa40.44■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 IL16Q14005 1332 aa40.43■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 CFAP44Q96MT7 982 aa40.43■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 PALLDQ8WX93 1383 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 GNAI1P63096 354 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 PAPPAQ13219 1627 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 ZNF790Q6PG37 636 aa40.41■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 CCDC125Q86Z20 511 aa40.41■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 TTC5Q8N0Z6 440 aa40.41■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.41■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 CHL1O00533 1208 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 KCNQ3O43525 872 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 ZNF853P0CG23 659 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 BABAM1Q9NWV8 329 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 ZBED9Q6R2W3 1325 aa40.38■■■■■ 4.06
SLC25A28-201ENST00000370495 GOLGA2Q08379 1002 aa40.37■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 MBIPQ9NS73 344 aa40.36■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 KDM3BQ7LBC6 1761 aa40.35■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 PLSCR1O15162 318 aa40.34■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 BAG6P46379 1132 aa40.34■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 KCPQ6ZWJ8 1503 aa40.33■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
SLC25A28-201ENST00000370495 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 DEFB132Q7Z7B7 95 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 CDCA7LQ96GN5 454 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 FMNL2Q96PY5 1086 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 UBR2Q8IWV8 1755 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 SIK1P57059 783 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 MYH16Q9H6N6 1097 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 FANCIQ9NVI1 1328 aa40.28■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 E9PSI1 815 aa40.28■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 LY75O60449 1722 aa40.26■■■■■ 4.04
SLC25A28-201ENST00000370495 SLFN5Q08AF3 891 aa40.26■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 SLC4A9Q96Q91 983 aa40.26■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 CAMKK2Q96RR4 588 aa40.26■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 TXNRD1Q16881 649 aa40.25■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 HEG1Q9ULI3 1381 aa40.25■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa40.24■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 KCNQ4P56696 695 aa40.24■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 ATP6V1AP38606 617 aa40.23■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 PROM2Q8N271 834 aa40.23■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 KRT24Q2M2I5 525 aa40.21■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 SLC27A3Q5K4L6 730 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 VSIG10Q8N0Z9 540 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 LRRC4BQ9NT99 713 aa40.19■■■■■ 4.03
SLC25A28-201ENST00000370495 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 ITPK1Q13572 414 aa40.18■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 DNAJC10Q8IXB1 793 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa40.16■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 ZNF831Q5JPB2 1677 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 C8orf58Q8NAV2 365 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 TJP1Q07157 1748 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
SLC25A28-201ENST00000370495 DUSP27Q5VZP5 1158 aa40.13■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 LINC00116Q8NCU8 138 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 C5P01031 1676 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 TSPYL6Q8N831 410 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 RREB1Q92766 1687 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 USP16Q9Y5T5 823 aa40.09■■■■■ 4.01
SLC25A28-201ENST00000370495 STARD3NLO95772 234 aa40.06■■■■■ 4
SLC25A28-201ENST00000370495 HOXB7P09629 217 aa40.06■■■■■ 4
SLC25A28-201ENST00000370495 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
SLC25A28-201ENST00000370495 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
SLC25A28-201ENST00000370495 SOCS7O14512 581 aa40.05■■■■■ 4
SLC25A28-201ENST00000370495 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
SLC25A28-201ENST00000370495 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.1 ms