RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357276.8

SMARCAL1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene SMARCAL1, Length 3,271 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1-201ENST00000357276 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 HMOX1P09601 288 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.69□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 PLEKHG5O94827 1062 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 PDE1AP54750 535 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.68□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 PTPRCP08575 1304 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 USP48Q86UV5 1035 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 PRAM1Q96QH2 718 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 PALD1Q9ULE6 856 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ATP2B3Q16720 1220 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 TSC1Q92574 1164 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 KIF3AQ9Y496 699 aa14.67□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 KIF20AO95235 890 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 FBLN1P23142 703 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 MLECQ14165 292 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ARID3AQ99856 593 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 CABP1Q9NZU7 370 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ADCY5O95622 1261 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ANKRD7Q92527 254 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 USP25Q9UHP3 1055 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 SLIT1O75093 1534 aa14.66□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 MEIS3Q99687 375 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 CDK19Q9BWU1 502 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 MX1P20591 662 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCAL1-201ENST00000357276 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 STK26Q9P289 416 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 FAM83GA6ND36 823 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 KDM4AO75164 1064 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 KRT24Q2M2I5 525 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 CHL1O00533 1208 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 CHMLP26374 656 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 MCCP23508 829 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 HMMRO75330 724 aa14.61□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 CBX1P83916 185 aa14.61□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.61□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 AP5Z1O43299 807 aa14.61□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 STAP2Q9UGK3 403 aa14.61□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.61□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 DIP2AQ14689 1571 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 UBE2HP62256 183 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 DCTN1Q14203 1278 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 APBB1O00213 710 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 TPM3P06753 285 aa14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 AKAP12Q02952 1782 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 CPS1P31327 1500 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 TECPR2O15040 1411 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 HSPA4P34932 840 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 MPNDQ8N594 471 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.59□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.58□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.58□□□□□ -0.07
SMARCAL1-201ENST00000357276 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 CRB1P82279 1406 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 ARHGEF10O15013 1369 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 AOX1Q06278 1338 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 SYCP1Q15431 976 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 TTC14Q96N46 770 aa14.58□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 ITSN1Q15811 1721 aa14.57□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.57□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SMARCAL1-201ENST00000357276 FAM177BA6PVY3 158 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms