RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 NBPF3Q9H094 633 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 DEF6Q9H4E7 631 aa9.91□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 CD109Q6YHK3 1445 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 SSFA2P28290 1259 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 GPT2Q8TD30 523 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 MCTP2Q6DN12 878 aa9.9□□□□□ -0.82
LMO3-204ENST00000354662 LIG1P18858 919 aa9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ANAPC15P60006 121 aa9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 CASC1Q6TDU7 716 aa9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TMX1Q9H3N1 280 aa9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TRIM66O15016 1216 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 KIF2CQ99661 725 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 PTPRCP08575 1304 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 INHBEP58166 350 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 PACS2Q86VP3 889 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 C21orf2O43822 256 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 NUCB2P80303 420 aa9.89□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 CDCA8Q53HL2 280 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ZFYVE9O95405 1425 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MTA1Q13330 715 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MKL1Q969V6 931 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 USP47Q96K76 1375 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 RNF20Q5VTR2 975 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 DRC1Q96MC2 740 aa9.88□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 CTAGE5O15320 804 aa9.87□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 PKD2Q13563 968 aa9.87□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MPNDQ8N594 471 aa9.87□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.87□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 COQ9O75208 318 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MBD3O95983 291 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TEX35Q5T0J7 233 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 CFAP44Q96MT7 982 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TSPY26PQ9H489 355 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 KRBA2Q6ZNG9 492 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 USP25Q9UHP3 1055 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MAP2K2P36507 400 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TOMM22Q9NS69 142 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ADGRB1O14514 1584 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.86□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SLFN5Q08AF3 891 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ZSCAN26Q16670 478 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 RPS6KA5O75582 802 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 AK9Q5TCS8 1911 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SYCE3A1L190 88 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SGSM2O43147 1006 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ATP8B1O43520 1251 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 MCTP1Q6DN14 999 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 PPM1EQ8WY54 764 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ST7Q9NRC1 585 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 TPM4P67936 248 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.84□□□□□ -0.83
LMO3-204ENST00000354662 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms