RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341735.3

MESP2-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP2, Length 1,552 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP2-201ENST00000341735 BTAF1O14981 1849 aa29■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 CCDC125Q86Z20 511 aa28.96■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 WWC1Q8IX03 1113 aa28.96■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
MESP2-201ENST00000341735 APBA3O96018 575 aa28.95■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 BTBD11A6QL63 1104 aa28.92■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 ATG3Q9NT62 314 aa28.92■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.92■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 SLC39A6Q13433 755 aa28.89■■■□□ 2.22
MESP2-201ENST00000341735 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.88■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 PLSCR1O15162 318 aa28.88■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 WDR63Q8IWG1 891 aa28.88■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 PAPPAQ13219 1627 aa28.87■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 ZNF521Q96K83 1311 aa28.87■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 BAG6P46379 1132 aa28.87■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 PALLDQ8WX93 1383 aa28.86■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 ZNF790Q6PG37 636 aa28.86■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.86■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 CFAP44Q96MT7 982 aa28.86■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.86■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 IFT57Q9NWB7 429 aa28.85■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.85■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 GNAI1P63096 354 aa28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 LY75O60449 1722 aa28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 IL16Q14005 1332 aa28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 CHL1O00533 1208 aa28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 KCNQ3O43525 872 aa28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.84■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.83■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 ZNF853P0CG23 659 aa28.83■■■□□ 2.21
MESP2-201ENST00000341735 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.82■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.8■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.79■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 SIK1P57059 783 aa28.79■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.79■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 GOLGA2Q08379 1002 aa28.79■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 MBIPQ9NS73 344 aa28.79■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 TXNRD1Q16881 649 aa28.78■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 PROM2Q8N271 834 aa28.77■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.77■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
MESP2-201ENST00000341735 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.76■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.76■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.75■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 ATP6V1AP38606 617 aa28.75■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.74■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.73■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 SOCS7O14512 581 aa28.73■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 KCNQ4P56696 695 aa28.73■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.73■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.73■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.72■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 E9PSI1 815 aa28.71■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.71■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 RREB1Q92766 1687 aa28.71■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 SLFN5Q08AF3 891 aa28.71■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.71■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.7■■■□□ 2.19
MESP2-201ENST00000341735 ITPK1Q13572 414 aa28.7■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 TJP1Q07157 1748 aa28.68■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.68■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 KRT24Q2M2I5 525 aa28.67■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 C5P01031 1676 aa28.67■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.66■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.65■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.64■■■□□ 2.18
MESP2-201ENST00000341735 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 USP16Q9Y5T5 823 aa28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 STARD3NLO95772 234 aa28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.62■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.61■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
MESP2-201ENST00000341735 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 221.7 ms