RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 MX1P20591 662 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 SLFN5Q08AF3 891 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 NEBLO76041 1014 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 F6X3S4 739 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 PLCD4Q9BRC7 762 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1328Q86T90 577 aa26.2■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 GUCY1B3Q02153 619 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 SCLT1Q96NL6 688 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 NAPBQ9H115 298 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC96Q2M329 555 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 SMTNL1A8MU46 457 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 RAB11FIP3O75154 756 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP100Q494V2 611 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 SYCE3A1L190 88 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 GPTP24298 496 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 TNIP1Q15025 636 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF11O15085 1522 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 WDR97A6NE52 1622 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 FOXO3O43524 673 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K11Q16584 847 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 SLC5A1P13866 664 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 DESP17661 470 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 SKAP1Q86WV1 359 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TAF4BQ92750 862 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 WDR78Q5VTH9 848 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TIAM1Q13009 1591 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 CALRP27797 417 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ERLIN1O75477 346 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K12Q12852 859 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TOPBP1Q92547 1522 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TAF3Q5VWG9 929 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 UQCRHP07919 91 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 MCM4P33991 863 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 LIG1P18858 919 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF213O14771 459 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 IQCEQ6IPM2 695 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 IL27Q8NEV9 243 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0754O94854 1291 aa26.08■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 C8orf76Q96K31 380 aa26.08■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC66A2RUB6 948 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WZG4 1122 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms