RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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MVB12A-201ENST00000317040 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.28■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.28■■□□□ 1.32
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MVB12A-201ENST00000317040 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.27■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 RNF214Q8ND24 703 aa23.27■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 KIF3AQ9Y496 699 aa23.27■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 TPM3P06753 285 aa23.26■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 MBIPQ9NS73 344 aa23.26■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 STK26Q9P289 416 aa23.26■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 RTL1A6NKG5 1358 aa23.26■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 SSH2Q76I76 1423 aa23.26■■□□□ 1.31
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MVB12A-201ENST00000317040 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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MVB12A-201ENST00000317040 NEK4P51957 841 aa23.22■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.22■■□□□ 1.31
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MVB12A-201ENST00000317040 RGS12O14924 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.21■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.21■■□□□ 1.31
MVB12A-201ENST00000317040 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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MVB12A-201ENST00000317040 PTPRCP08575 1304 aa23.18■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 ATP7BP35670 1465 aa23.18■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 ADCY5O95622 1261 aa23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 TAF3Q5VWG9 929 aa23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 POLKQ9UBT6 870 aa23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 NWD1Q149M9 1564 aa23.17■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 MX1P20591 662 aa23.16■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.16■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD7Q92527 254 aa23.16■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 FEZ1Q99689 392 aa23.16■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.16■■□□□ 1.3
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MVB12A-201ENST00000317040 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.15■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 USP25Q9UHP3 1055 aa23.15■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 KDM4AO75164 1064 aa23.14■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 USP48Q86UV5 1035 aa23.14■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.14■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.14■■□□□ 1.3
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA0232Q92628 1395 aa23.14■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 PDE1AP54750 535 aa23.14■■□□□ 1.29
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MVB12A-201ENST00000317040 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.14■■□□□ 1.29
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MVB12A-201ENST00000317040 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 IL13P35225 146 aa23.12■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 PRAM1Q96QH2 718 aa23.12■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.12■■□□□ 1.29
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MVB12A-201ENST00000317040 CBX1P83916 185 aa23.12■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 ATP2B3Q16720 1220 aa23.12■■□□□ 1.29
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MVB12A-201ENST00000317040 MSH6P52701 1360 aa23.11■■□□□ 1.29
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MVB12A-201ENST00000317040 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.1■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.1■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM94Q12767 1356 aa23.1■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 CPS1P31327 1500 aa23.1■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 DLC1Q96QB1 1528 aa23.09■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.09■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.08■■□□□ 1.29
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 AOX1Q06278 1338 aa23.07■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 HMOX1P09601 288 aa23.06■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 TSC1Q92574 1164 aa23.05■■□□□ 1.28
MVB12A-201ENST00000317040 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.05■■□□□ 1.28
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