RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.27■■■□□ 2.92
CXCL2-201ENST00000296031 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.25■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.25■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 GNAT3A8MTJ3 354 aa33.25■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 SIK1P57059 783 aa33.25■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 MRC1P22897 1456 aa33.25■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 SLC52A2Q9HAB3 445 aa33.24■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 QSER1Q2KHR3 1735 aa33.23■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa33.22■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 C4BP0C0L5 1744 aa33.2■■■□□ 2.91
CXCL2-201ENST00000296031 NEFMP07197 916 aa33.19■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 ATP6V1AP38606 617 aa33.19■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 IL17REQ8NFR9 667 aa33.19■■■□□ 2.9
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CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB7AO95365 584 aa33.17■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 PLEKHF1Q96S99 279 aa33.17■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 ITPK1Q13572 414 aa33.16■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 LINC00116Q8NCU8 138 aa33.16■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 SPON1Q9HCB6 807 aa33.16■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa33.16■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF831Q5JPB2 1677 aa33.16■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 TEFQ10587 303 aa33.14■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 AK7Q96M32 723 aa33.14■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 SLC4A9Q96Q91 983 aa33.14■■■□□ 2.9
CXCL2-201ENST00000296031 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.12■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 SLC39A6Q13433 755 aa33.12■■■□□ 2.89
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CXCL2-201ENST00000296031 DLG5Q8TDM6 1919 aa33.12■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa33.1■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 UBR3Q6ZT12 1888 aa33.1■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 MSH5O43196 834 aa33.08■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 MCM10Q7L590 875 aa33.08■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 MTFR1LQ9H019 292 aa33.08■■■□□ 2.89
CXCL2-201ENST00000296031 ANP32CO43423 234 aa33.07■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 TJP1Q07157 1748 aa33.07■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 NFE2L2Q16236 605 aa33.06■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 KCPQ6ZWJ8 1503 aa33.06■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 DCTN1Q14203 1278 aa33.05■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 SLC16A10Q8TF71 515 aa33.05■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 UBR2Q8IWV8 1755 aa33.05■■■□□ 2.88
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CXCL2-201ENST00000296031 PHF14O94880 888 aa33.04■■■□□ 2.88
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CXCL2-201ENST00000296031 ADAMTS8Q9UP79 889 aa33.04■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 GNPATO15228 680 aa33.03■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 AMIGO3Q86WK7 504 aa33.03■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 TTC5Q8N0Z6 440 aa33.03■■■□□ 2.88
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
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CXCL2-201ENST00000296031 CCDC146Q8IYE0 955 aa33.01■■■□□ 2.87
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CXCL2-201ENST00000296031 ZNF790Q6PG37 636 aa33■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa33■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 BTBD11A6QL63 1104 aa32.99■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 SSFA2P28290 1259 aa32.99■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJC10Q8IXB1 793 aa32.98■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 VSIG10Q8N0Z9 540 aa32.97■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC184Q52MB2 194 aa32.96■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 RUNDC1Q96C34 613 aa32.96■■■□□ 2.87
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CXCL2-201ENST00000296031 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.95■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 CRKLP46109 303 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 RIPK4P57078 832 aa32.95■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 SGIP1Q9BQI5 828 aa32.95■■■□□ 2.87
CXCL2-201ENST00000296031 TMPOP42166 694 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 KCNQ3O43525 872 aa32.93■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 RPS6KA4O75676 772 aa32.92■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 MSL1Q68DK7 614 aa32.92■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 POLD1P28340 1107 aa32.91■■■□□ 2.86
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CXCL2-201ENST00000296031 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
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CXCL2-201ENST00000296031 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 TRAPPC3LQ5T215 181 aa32.9■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 NEUROD2Q15784 382 aa32.89■■■□□ 2.86
CXCL2-201ENST00000296031 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
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CXCL2-201ENST00000296031 ARXQ96QS3 562 aa32.88■■■□□ 2.85
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC87Q9NVE4 849 aa32.88■■■□□ 2.85
CXCL2-201ENST00000296031 LMOD3Q0VAK6 560 aa32.87■■■□□ 2.85
CXCL2-201ENST00000296031 MRS2Q9HD23 443 aa32.87■■■□□ 2.85
CXCL2-201ENST00000296031 C4AP0C0L4 1744 aa32.86■■■□□ 2.85
CXCL2-201ENST00000296031 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
CXCL2-201ENST00000296031 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
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