RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283309.10

FRMD1-201, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene FRMD1, Length 3,067 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-201ENST00000283309 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 DTNBO60941 627 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 TEFQ10587 303 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 SDSP20132 328 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 SSH2Q76I76 1423 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 MCM4P33991 863 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 CHRNA2Q15822 529 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 RGS12O14924 1447 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 CDC45O75419 566 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 HSPA2P54652 639 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 ARHGEF10O15013 1369 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-201ENST00000283309 GCP02774 474 aa14.71□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 SLC39A6Q13433 755 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 TRAK2O60296 914 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 GNAI2P04899 355 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 TTC22Q5TAA0 569 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 BTBD11A6QL63 1104 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 PTPRCP08575 1304 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 KIF2CQ99661 725 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 ATP10DQ9P241 1426 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 MAP3K5Q99683 1374 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 PROSER3Q2NL68 480 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 CLCN1P35523 988 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 IP6K1Q92551 441 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 PIK3C2AO00443 1686 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 HMMRO75330 724 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 MYL6BP14649 208 aa14.67□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 KIAA0232Q92628 1395 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 KDRP35968 1356 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 SRGAP3O43295 1099 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 USP44Q9H0E7 712 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD1-201ENST00000283309 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 PDE1AP54750 535 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 FSD2A1L4K1 749 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 PKP1Q13835 747 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 ESPNB1AK53 854 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 SSFA2P28290 1259 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 ERBB4Q15303 1308 aa14.63□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 SIL1Q9H173 461 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 MRE11P49959 708 aa14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 CASC1Q6TDU7 716 aa14.61□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 MX1P20591 662 aa14.61□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 GNAI3P08754 354 aa14.6□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.6□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.6□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 USP26Q9BXU7 913 aa14.6□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 IL25Q9H293 177 aa14.6□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.6□□□□□ -0.07
FRMD1-201ENST00000283309 ATF3P18847 181 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms