RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 KIF3AQ9Y496 699 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 DCCP43146 1447 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 BRD2P25440 801 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 PANK1Q8TE04 598 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 FEZ1Q99689 392 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 TNNQ9UQP3 1299 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 TSC1Q92574 1164 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ4P48050 445 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 SOX12O15370 315 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 PSME1Q06323 249 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 SLAIN2Q9P270 581 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 IL16Q14005 1332 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 CCDC66A2RUB6 948 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 PEAK1Q9H792 1746 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 USP31Q70CQ4 1352 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 COG6Q9Y2V7 657 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 NFE2L2Q16236 605 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 IGSF3O75054 1194 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 RLBP1P12271 317 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 OGFRQ9NZT2 677 aa26.7■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.7■■□□□ 1.87
PITX1-201ENST00000265340 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 SSFA2P28290 1259 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD7Q92527 254 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 BRINP3Q76B58 766 aa26.68■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 PIK3C2AO00443 1686 aa26.67■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.67■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 TIGD1Q96MW7 591 aa26.67■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.67■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.867e-9■□□□□ 8.1
PITX1-201ENST00000265340 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 ABTB2Q8N961 1025 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 TULP2O00295 520 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX1-201ENST00000265340 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.64■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 SLFN14P0C7P3 912 aa26.63■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 NLRP6P59044 892 aa26.63■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.63■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 TSPYL1Q9H0U9 437 aa26.63■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.62■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.62■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 FAM83GA6ND36 823 aa26.61■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 KIF1AQ12756 1690 aa26.61■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.61■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 DCTN1Q14203 1278 aa26.59■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.58■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.58■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.58■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PITX1-201ENST00000265340 FAM177BA6PVY3 158 aa26.57■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 ZNF853P0CG23 659 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 MMP14P50281 582 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 MCTP1Q6DN14 999 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 SBNO1A3KN83 1393 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 TRIM27P14373 513 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 CAPN2P17655 700 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 FLT4P35916 1363 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 PIP4K2BP78356 416 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 YY1AP1Q9H869 796 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 MBIPQ9NS73 344 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 CTIFO43310 598 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 IFT57Q9NWB7 429 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 TSPYL6Q8N831 410 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 GNAI1P63096 354 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 AMPHP49418 695 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms