Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms