Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms