Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms