Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BBS2Q9BXC9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms