Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK3Q9BQ16 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SPOCK3Q9BQ16 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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