Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWDEQ8N2E2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWDEQ8N2E2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms