Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R42Q7Z4L9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R42Q7Z4L9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms