Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSRP2Q16527 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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