Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms