Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms