Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms