Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18530 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18530 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18530 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18530 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18530 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
P18530 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18530 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18530 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18530 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms