Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFAP15692 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms