Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms