Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q4

Ighv5-12, Immunoglobulin heavy variable 5-12 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv5-12A0A075B5Q4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms