Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PHF3Q92576 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PHF3Q92576 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PHF3Q92576 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PHF3Q92576 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PHF3Q92576 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PHF3Q92576 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PHF3Q92576 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PHF3Q92576 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PHF3Q92576 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PHF3Q92576 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PHF3Q92576 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PHF3Q92576 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
PHF3Q92576 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PHF3Q92576 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PHF3Q92576 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
PHF3Q92576 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
PHF3Q92576 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
PHF3Q92576 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
PHF3Q92576 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PHF3Q92576 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PHF3Q92576 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PHF3Q92576 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
PHF3Q92576 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
PHF3Q92576 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PHF3Q92576 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PHF3Q92576 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PHF3Q92576 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PHF3Q92576 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PHF3Q92576 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PHF3Q92576 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PHF3Q92576 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PHF3Q92576 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PHF3Q92576 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.1□□□□□ -2.91
PHF3Q92576 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PHF3Q92576 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PHF3Q92576 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PHF3Q92576 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PHF3Q92576 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PHF3Q92576 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PHF3Q92576 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PHF3Q92576 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PHF3Q92576 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PHF3Q92576 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PHF3Q92576 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PHF3Q92576 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PHF3Q92576 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PHF3Q92576 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PHF3Q92576 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PHF3Q92576 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PHF3Q92576 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PHF3Q92576 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PHF3Q92576 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
PHF3Q92576 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
PHF3Q92576 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.4 ms