Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SHROOM2Q13796 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SHROOM2Q13796 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
SHROOM2Q13796 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
SHROOM2Q13796 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
SHROOM2Q13796 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-5.59□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
SHROOM2Q13796 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SHROOM2Q13796 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SHROOM2Q13796 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SHROOM2Q13796 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SHROOM2Q13796 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
SHROOM2Q13796 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-5.66□□□□□ -3.32
SHROOM2Q13796 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-5.66□□□□□ -3.32
SHROOM2Q13796 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
SHROOM2Q13796 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
SHROOM2Q13796 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
SHROOM2Q13796 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
SHROOM2Q13796 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
SHROOM2Q13796 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
SHROOM2Q13796 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
SHROOM2Q13796 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-5.77□□□□□ -3.33
SHROOM2Q13796 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.34
SHROOM2Q13796 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
SHROOM2Q13796 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
SHROOM2Q13796 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
SHROOM2Q13796 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
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SHROOM2Q13796 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
SHROOM2Q13796 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
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SHROOM2Q13796 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-6.51□□□□□ -3.45
SHROOM2Q13796 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-6.54□□□□□ -3.46
SHROOM2Q13796 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-6.56□□□□□ -3.46
SHROOM2Q13796 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-6.56□□□□□ -3.46
SHROOM2Q13796 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-6.58□□□□□ -3.46
SHROOM2Q13796 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-6.59□□□□□ -3.46
SHROOM2Q13796 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
SHROOM2Q13796 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
SHROOM2Q13796 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
SHROOM2Q13796 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-6.68□□□□□ -3.48
SHROOM2Q13796 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
SHROOM2Q13796 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
SHROOM2Q13796 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
SHROOM2Q13796 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
SHROOM2Q13796 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-6.73□□□□□ -3.49
SHROOM2Q13796 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
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