Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.39□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CACNA1SQ13698 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CACNA1SQ13698 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CACNA1SQ13698 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CACNA1SQ13698 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CACNA1SQ13698 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CACNA1SQ13698 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CACNA1SQ13698 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CACNA1SQ13698 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CACNA1SQ13698 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CACNA1SQ13698 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CACNA1SQ13698 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CACNA1SQ13698 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CACNA1SQ13698 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CACNA1SQ13698 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CACNA1SQ13698 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CACNA1SQ13698 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CACNA1SQ13698 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CACNA1SQ13698 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CACNA1SQ13698 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CACNA1SQ13698 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CACNA1SQ13698 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CACNA1SQ13698 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CACNA1SQ13698 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CACNA1SQ13698 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CACNA1SQ13698 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CACNA1SQ13698 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CACNA1SQ13698 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CACNA1SQ13698 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.6 ms