Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
IMPG1Q17R60 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
IMPG1Q17R60 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
IMPG1Q17R60 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
IMPG1Q17R60 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.72□□□□□ -3
IMPG1Q17R60 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
IMPG1Q17R60 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
IMPG1Q17R60 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.79□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.84□□□□□ -3.02
IMPG1Q17R60 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
IMPG1Q17R60 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.91□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
IMPG1Q17R60 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
IMPG1Q17R60 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
IMPG1Q17R60 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
IMPG1Q17R60 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
IMPG1Q17R60 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
IMPG1Q17R60 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
IMPG1Q17R60 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
IMPG1Q17R60 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
IMPG1Q17R60 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
IMPG1Q17R60 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
IMPG1Q17R60 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
IMPG1Q17R60 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms